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CAUSA: 基于密码子-氨基酸联合序列比对构建高精确度分子进化树 生物信息学、基因组学(包括功能基因组学和比较基因组学)的主要目的是研究生物基因、蛋白和基因组的结构和功能,并重构生物基因、蛋白和基因组的进化历史。多序列比对(multiple sequence alignment, MSA)是DNA和蛋白质分子进化分析、以及结构与功能研究的基本工具。目前多序列比对已经有很多方法,如clustalw, MUSCLE, MAFFT, T-Coffee, PRANK,等等,但序列比对依然容易产生系统性
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Multiple Sequence Alignment Using Maximum Spanning Tree
生物信息学中一个重要topic:多序列联配。这里用最大生成树的思想来进行联配,算法为C语言实现。本程序在Dev-C++,Win Vista环境下实现。-Multiple Sequence Alignment Using Maximum Spanning Tree Bioinformatics an important topic: Multiple Sequence Alignme
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多序列比对方法的一个研究,但是没有源代码!-Multiple sequence alignment of a research method, but no source code!
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图形化多序列比对编辑器,能够读各种比对格式(MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE),可手动编辑队列。-Graphical multiple sequence alignment editor, able to read various alignment formats (MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE), you can manually edit the queue.
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基于WEB的常用序列分析工具集。可以用于多种序列比对分析!-WEB-based sequence analysis tools commonly used. Can be used for multiple sequence alignment analysis!
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经过汉化的多序列比对软件,但有时候会出现小小的错误-After localization of multiple sequence alignment software, but sometimes there will be a small error
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VCVC类遗传算法(完全变异法),对于解决多序列联配问题有一定的作用,由于完全变异法有两个随机数的,所以结果波动幅度较大,最佳遗传代数为200代,多序列联配的补空方案请自行调节。代码简单,方便。-Genetic algorithm VCVC class (full variability Law), to solve the multiple sequence alignment problem to a certain extent, there are two random numbers
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causa多序列比对软件,用于生物基因数据库的专业比对-causa multiple sequence alignment software for bio-genetic database of professional comparison
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