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ABCSMC_sysbio.tar
- 基于近似贝叶斯计算思想,用于系统生物学里模块功能搜索,结构筛选,参数区间权重划分。强大之处在于,练习者只须用新的生物case编一个input文件即可。输出量为模型,参数的权重。欲改进者可考虑引进粒子滤波中的权重给定方法。-Approximate Bayesian Computation in Python with GPU support。
network-module
- 根据图模块划分原理,结合聚类算法蛋白质相似度矩阵的构建的网络进行谱聚类算法-spectral clustering of protein Matrix