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MonteCarlo
- 蒙特卡罗(Monte Carlo)方法,又称随机抽样或统计试验方法,属于计算数学的一个分支,它是在本世纪四十年代中期为了适应当时原子能事业的发展而发展起来的。传统的经验方法由于不能逼近真实的物理过程,很难得到满意的结果,而蒙特卡罗方法由于能够真实地模拟实际物理过程,故解决问题与实际非常符合,可以得到很圆满的结果。
DEGREE
- 1、提取原蛋白质相互作用网络的所有节点 2、分别计算原蛋白质相互作用网络每个节点的度 3、从所有节点中选择具有最高度的节点,反复的添加边,直到它的度值等于原蛋白质相互作用网络该节点的度值 4、在为节点添加边时,从剩余节点中选择节点的方法是其度分布近似服从power-low分布 5、令t的值为零,则每个节点被选到的可能性都是相同的,由于在原蛋白质相互作用网络存在大量的低度节点,所以集散节点会优先连接低度节点。 这样创建的网络就为负相关蛋白质互作网络
数据拟合终结版
- 计算方法数据拟合-data fitting calculation method
GA-VC
- 遗传算法(Genetic Algorithm)是模拟达尔文生物进化论的自然选择和遗传学机理的生物进化过程的计算模型,是一种通过模拟自然进化过程搜索最优解的方法。压缩包中包含了由C++语言编写的算法。-Genetic Algorithm (Genetic Algorithm) is a simulation of the biological theory of evolution Darwin' s natural selection and genetic mechanism of th
ABCSMC_sysbio.tar
- 基于近似贝叶斯计算思想,用于系统生物学里模块功能搜索,结构筛选,参数区间权重划分。强大之处在于,练习者只须用新的生物case编一个input文件即可。输出量为模型,参数的权重。欲改进者可考虑引进粒子滤波中的权重给定方法。-Approximate Bayesian Computation in Python with GPU support。
DNA
- 基因序列比较 人类基因由4种核苷酸,分别用字母ACTG表示。要求编写一个程序,按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度。即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG,它们有多相似呢?测量两个基因的相似度一种方法称为对齐。使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格,让两个基因的长度相等,然后根据基因的分值矩阵计算分数。 A C G T - A 5 -1 -2 -1 -3 C -1 5 -3 -2 -4 G -2 -3 5 -2 -2 T -1 -2 -2 5
rcwa-1d_4_6_2014
- 一维表面光栅MATLAB 源程序代码,应用耦合波理论分析方法计算模拟(One-dimensional surface grating MATLAB source code, the use of coupled wave theory analysis method of simulation)