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sequtoarray
- 将一个fasta格式的序列文件中所有序列提取出来以数组形式储存起来,有几条序列就存几个数组,同时序列的名字也要一起提供-Extracted all sequences in a fasta sequence file format to store an array, there are a few sequences on deposit several array, while the name of the sequence should be provided with
script1.tar
- 为了加入这个网站,我把心血分享给大家,绝对都是原创! A:mkdatabas0.cpp 做blast前对大的非冗余NR或者是uniref数据库的预处理。为每条序列计算出等长的(长度为20*19/2=210)的数值数组。用来后期比较各个序列间的距离做准备。 B:mkdatabas.cpp 是通过比较要blast对象的那条序列和reference序列的距离,提出距离过远序列。用得到的新数据库做blast。 C:dl_fa.pl程序比较简单,但很实用,可以批量的从网站下载想要的fasta序