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SENSEgfactorcalculation
- 计算SENSE重建图像中的g-factor,这是并行磁共振成像SENSE算法的关键一步-G-factor is the metric to quantify the amplificaiton of noise power in reconstructing SENSE accelerated image. The detail was presented in Pruessmann s 1999 Magn. Reson. Med. paper. In theory, g-factor is t
sequtoarray
- 将一个fasta格式的序列文件中所有序列提取出来以数组形式储存起来，有几条序列就存几个数组，同时序列的名字也要一起提供-Extracted all sequences in a fasta sequence file format to store an array, there are a few sequences on deposit several array, while the name of the sequence should be provided with
viterbiaEM
- 1.用隐马尔科夫模型（HMM）模拟肿瘤细胞整个染色体的拷贝数（CN）变异。并用viteri算法得到最可能的（CN）状态转移序列； 2.使用baum welch算法根据所给序列数据和初始状态转移矩阵，重新估算状态转移矩阵。-HMM, Hidden Markov, baulm welch, viterbi, SNP-array
script1.tar
- 为了加入这个网站，我把心血分享给大家，绝对都是原创！ A：mkdatabas0.cpp 做blast前对大的非冗余NR或者是uniref数据库的预处理。为每条序列计算出等长的（长度为20*19/2=210）的数值数组。用来后期比较各个序列间的距离做准备。 B：mkdatabas.cpp 是通过比较要blast对象的那条序列和reference序列的距离，提出距离过远序列。用得到的新数据库做blast。 C：dl_fa.pl程序比较简单，但很实用，可以批量的从网站下载想要的fasta序
NTF_CP_ERP-Tensor-TFR
- 本软件可用来计算ERP的张量分解张量是多路数据数组。ERP张量在这里包括四个模式：时间、频率、空间和主题。-Note: Tensor is multi-way data array.ERP tensor here includes four modes of time, frequency, space and subject.