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ABCSMC_sysbio.tar
- 基于近似贝叶斯计算思想,用于系统生物学里模块功能搜索,结构筛选,参数区间权重划分。强大之处在于,练习者只须用新的生物case编一个input文件即可。输出量为模型,参数的权重。欲改进者可考虑引进粒子滤波中的权重给定方法。-Approximate Bayesian Computation in Python with GPU support。
cuda-meme-3.0.12
- 此程序用于GPU实现的对生物科学中的motif discovery算法进行加速-Accelerating Motif Discovery in Biological Sequences Using CUDA-enabled Graphics Processing Units